В состав района входят 2 городских и 2 сельских поселения, которые являются вновь образованными муниципальными образованиями:
городское поселение Кандалакша с населенными пунктами:
город Кандалакша (административный центр поселения),
с.Лувеньга,
с.Колвица,
с.Федосеевка,
н.п.Нивский,
н.п.Белое Море,
ж.д.ст.Пинозеро,
ж.д.ст.Проливы,
ж.д.ст.Ручьи;

городское поселение Зеленоборский c населенными пунктами:
п.г.т.Зеленоборский (административный центр поселения),
с.Княжая Губа,
с.Ковда,
н.п.Пояконда,
н.п.Лесозаводский,
ж.д.ст. Ковда,
ж.д.ст.Жемчужная;

сельское поселение Зареченск с населенными пунктами:
н.п.Зареченск (административный центр поселения),
с.Ковдозеро,
ж.д.ст.Нямозеро;

сельское поселение Алакуртти с населенными пунктами:
с.Алакуртти (административный центр поселения),
н.п. Кайралы,
н.п.Куолоярви,
н.п.Приозерный.